Trois écoles maternelles, deux écoles élémentaires et un collège forment la vie scolaire Cléonnaise. Les établissements sont tous dotés des nouvelles technologies avec des salles informatiques. Toutes les classes sont équipées d’un ordinateur et d’un tableau blanc interactif.
Afin de favoriser l’accès à la culture et l’égalité des chances, la ville de Cléon finance de nombreux projets pédagogiques comme les classes de découvertes. En collaboration avec la Traverse, les écoliers découvrent au moins trois spectacles par an.
La municipalité soutient autant que possible les classes de découverte, les activités pédagogiques et les projets pédagogiques innovants. Chaque année, la ville organise la « Quinzaine de la Petite Enfance » et la Semaine de la « Plantation », deux animations auxquelles les enfants Cléonnais participent.